У меня такая же ситуация началась с зимы, температура минусовая ещё была. Коробка робот, пробег 95 тысяч. Загнал в сервис, поменяли масло в коробке, ситуация не поменялась. Заметил закономерность, при повышении температуры окружающего воздуха примерно до -5 и выше, проблема пропадает. Мастера посоветовали поменять стиль езды на более жёсткий, чтобы коробка перестроилась. Сказали, что возможно это синхронизатор 3 передачи подгорел или износился, у меня проблемы с переключением со 2 на 3. Тут и весна пришла, и проблема ушла. До сих пор езжу без щелчков, посмотрим что будет с наступлением заморозков.